داستان اصلی قهرمان اسطوره ای یونان. به هرکول توسط ناپدری اش که اکنون پادشاه است، خیانت شده و به دلیل عشقی ممنوعه تبعید شده و به بردگی فروخته شده است، باید از قدرت ماورایی خود برای بازگشت به پادشاهی قانونی خود استفاده کند.
در سال 1999 میلادی، پروفسور آلن نیمن و کانر مک‌لئود سپری برای محافظت از زمین در برابر تشعشعات ناشی از آسیب در لایه اوزون ایجاد کردند. بیست و پنج سال بعد، زمین به دلیل تاثیرات این سپر در حال نابودی است و گروه تروریستی به فرماندهی لوئیز مارکوس در تلاش برای از بین بردن این سپر هستند اما…
در مورد جادوگری به نام کانر مک‌لئود است که پس از مرگ همسر محبوبش، ارتفاعات اسکاتلند را ترک کرده و سرگردان می‌شود. در این میان او به ژاپن رفته و در آنجا با جادوگری معروف به نام ناکانو که یک جاودانه است، آشنا می‌شود
کاپیتان باربوسا و الیزابت سوآن و ویل ترنر برای نجات جک اسپارو و مروارید سیاه به سنگاپور می روند این در حالی است که آنها برای نجات کاپیتان جک اسپارو باید یک دزد دریایی چینی را پیدا کرده و نقشه دریایی که محل کاپیتان جک را نشان می دهد را از او بدزدند، در ادامه داستان مجمعی به نام برادران وارد داستان می شوند که باعث پیروزی دزدان دریایی کارائیب در مقابل کمپانی هند شرقی می شوند و…
ویل ترنر و الیزابت سوان که قصد دارند بزودی با هم ازدواج کنند بجرم کمک به کاپیتان جک اسپارو برای فرار از دست قانون بازداشت می شوند. لرد کاتر که دستور این بازداشت را داده به ویل و الیزابت می گوید اگر آنها به او کمک کنند تا جک را پیدا کرده و قطب نمای جادویی اش را از او بگیرد، آنها را مجازات نخواهد کرد…
«ناخدا باربوسا» کشتی «ناخدا جک اسپارو» به نام «مروارید سیاه» را در اختیار می گیرد و بعدا به شهر پورت رویال حمله می برد و «الیزابت سوان» دختر فرماندار (پرایس) را می رباید. «ویل ترنر» دوست دوران کودکی الیزابت با جک متحد می شود تا الیزابت را نجات دهند و مروارید سیاه را دوباره به چنگ آورند. اما نفرینی باعث شده باربوسا و خدمه اش برای همیشه در پرتو هر نور مهتابی به اسکلت هایی زنده تغییر شکل یابند…
